Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms