Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTIFO43310 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTIFO43310 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTIFO43310 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTIFO43310 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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