Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD3Q9NYL9 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMOD3Q9NYL9 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms