Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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