Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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