Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CASP12Q6UXS9 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CASP12Q6UXS9 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.3 ms