Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TMEM200BQ69YZ2 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TMEM200BQ69YZ2 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms