Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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