| TPRN | Q4KMQ1 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | Y_RNA.120-201 | ENST00000363304 | 110 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNA5SP126-201 | ENST00000365092 | 109 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-439P-201 | ENST00000384188 | 106 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | ATP6V0E1P3-201 | ENST00000420036 | 246 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC107297.1-201 | ENST00000459991 | 176 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-426P-201 | ENST00000516464 | 97 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SUMO2P16-201 | ENST00000519475 | 264 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AP003484.1-201 | ENST00000530974 | 250 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORA77B-201 | ENST00000578179 | 125 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | ELOCP29-201 | ENST00000588193 | 334 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | CHD9-202 | ENST00000398510 | 11337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | LINC01790-201 | ENST00000447194 | 2852 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | APC-201 | ENST00000257430 | 10701 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC010332.2-201 | ENST00000613083 | 1904 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-1067P-201 | ENST00000384752 | 107 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR3198-2-201 | ENST00000577868 | 80 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-457P-201 | ENST00000363999 | 107 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR512-1-201 | ENST00000384913 | 84 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR516B2-201 | ENST00000385190 | 85 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORA40-201 | ENST00000388090 | 126 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | U8.17-201 | ENST00000391292 | 132 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL358234.1-201 | ENST00000421132 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC090049.2-201 | ENST00000550377 | 109 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | GTF3AP2-201 | ENST00000557014 | 266 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | FAS-AS1.2-201 | ENST00000620386 | 170 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC095038.3-201 | ENST00000634439 | 195 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC008163.1-205 | ENST00000413944 | 4649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | PIK3C2G-206 | ENST00000538779 | 4963 nt | TSL 5 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD33-201 | ENST00000362761 | 85 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNA5SP259-201 | ENST00000365541 | 109 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR144-201 | ENST00000384886 | 86 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR653-201 | ENST00000385279 | 96 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | snoU13.9-201 | ENST00000458927 | 103 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | IGHVIII-67-2-201 | ENST00000519849 | 88 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AP001328.1-201 | ENST00000528550 | 176 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC015688.6-201 | ENST00000577737 | 104 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | FAM106DP-201 | ENST00000586416 | 501 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | TUG1_4.1-201 | ENST00000619464 | 181 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | ICE2P2-201 | ENST00000483823 | 2787 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-34-201 | ENST00000362441 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-12-201 | ENST00000362583 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-29-201 | ENST00000362834 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-9-201 | ENST00000362912 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-21-201 | ENST00000362963 | 81 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-14-201 | ENST00000363090 | 81 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-13-201 | ENST00000363358 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-41-201 | ENST00000363608 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-11-201 | ENST00000363616 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-5-201 | ENST00000363633 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-39-201 | ENST00000363694 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-4-201 | ENST00000363810 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-16-201 | ENST00000363887 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-6-201 | ENST00000363942 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-42-201 | ENST00000364273 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-15-201 | ENST00000364809 | 81 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-1-201 | ENST00000364961 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-26-201 | ENST00000365067 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-10-201 | ENST00000365073 | 81 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-43-201 | ENST00000365503 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-36-201 | ENST00000365629 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR526A1-201 | ENST00000384897 | 85 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC234781.5-202 | ENST00000453508 | 426 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORD115-40-201 | ENST00000606510 | 82 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | PYGO1-201 | ENST00000302000 | 8488 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AP003174.1-201 | ENST00000306533 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | Y_RNA.420-201 | ENST00000384043 | 110 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR3910-1-201 | ENST00000580936 | 111 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | Z82195.2-201 | ENST00000612348 | 18351 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | Y_RNA.52-201 | ENST00000362760 | 96 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-1336P-201 | ENST00000383886 | 109 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNA5SP210-201 | ENST00000391034 | 120 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | KRTAP19-11P-201 | ENST00000439851 | 104 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU7-80P-201 | ENST00000459562 | 61 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | LINC01068-202 | ENST00000620874 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | WWP1P1-201 | ENST00000466609 | 2769 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | Y_RNA.454-201 | ENST00000384224 | 113 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL451046.2-201 | ENST00000403074 | 277 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL590004.2-201 | ENST00000404787 | 371 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | HMGN2P19-201 | ENST00000425149 | 265 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL139132.1-201 | ENST00000431587 | 344 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | RNU6-406P-201 | ENST00000516470 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | MIR514B-201 | ENST00000516774 | 80 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORA18.7-201 | ENST00000516910 | 131 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | SNORA74.3-201 | ENST00000517108 | 154 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC107016.2-201 | ENST00000547968 | 190 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC025887.1-201 | ENST00000578349 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL513534.2-201 | ENST00000603836 | 250 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AC132825.6-201 | ENST00000638861 | 357 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | DYNC2H1-202 | ENST00000375735 | 13678 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TPRN | Q4KMQ1 | AL136360.1-201 | ENST00000503377 | 1900 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |