Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ME3Q16798 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ME3Q16798 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ME3Q16798 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms