Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
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