Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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