Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GABRA6Q16445 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GABRA6Q16445 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252 ms