Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ZFHX3Q15911 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZFHX3Q15911 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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