Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SF1Q15637 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SF1Q15637 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF1Q15637 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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