Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SS18Q15532 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SS18Q15532 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SS18Q15532 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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