Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23BQ15437 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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