Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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