Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.6 ms