Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NCAPHQ15003 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms