Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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