Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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GPNMBQ14956 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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