Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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