Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BECN1Q14457 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BECN1Q14457 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BECN1Q14457 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms