Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1CQ13936 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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