Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SNX1Q13596 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SNX1Q13596 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SNX1Q13596 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SNX1Q13596 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SNX1Q13596 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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