Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
TOP3AQ13472 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TOP3AQ13472 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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