Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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