Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NR1H3Q13133 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NR1H3Q13133 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NR1H3Q13133 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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