Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RESTQ13127 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RESTQ13127 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RESTQ13127 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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