Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.4 ms