Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1BQ13112 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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