Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MRPL28Q13084 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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