Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PRDM2Q13029 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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