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| PTPRJ | Q12913 | AC005899.2-201 | ENST00000584353 | 90 nt | BASIC | -0.01 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC008608.1-201 | ENST00000603910 | 127 nt | BASIC | -0.01 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EFCAB5-213 | ENST00000638539 | 168 nt | TSL 5 BASIC | -0.01 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.9-201 | ENST00000362354 | 101 nt | BASIC | -0.02 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.146-201 | ENST00000363549 | 102 nt | BASIC | -0.02 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-1209P-201 | ENST00000363655 | 107 nt | BASIC | -0.02 | □□□□□ -2.41 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.274-201 | ENST00000364714 | 101 nt | BASIC | -0.02 | □□□□□ -2.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RNU7-116P-201 | ENST00000516940 | 62 nt | BASIC | -0.02 | □□□□□ -2.41 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SNORD114-9-201 | ENST00000364370 | 72 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.310-201 | ENST00000365063 | 113 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RNU6-1076P-201 | ENST00000410397 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RNU6-355P-201 | ENST00000410427 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-791P-201 | ENST00000410467 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-705P-201 | ENST00000410601 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-1100P-201 | ENST00000410691 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-860P-201 | ENST00000410860 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-1217P-201 | ENST00000411276 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-785P-201 | ENST00000411324 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MCFD2P1-201 | ENST00000417812 | 300 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU7-102P-201 | ENST00000458948 | 62 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC024405.2-202 | ENST00000532731 | 184 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC008507.4-201 | ENST00000585464 | 127 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | U6.90-201 | ENST00000614007 | 104 nt | BASIC | -0.04 | □□□□□ -2.42 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | U8.7-201 | ENST00000364940 | 136 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RPS29P25-201 | ENST00000481709 | 171 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPL23AP54-201 | ENST00000495129 | 419 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC091959.1-201 | ENST00000495857 | 238 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC112693.2-201 | ENST00000556538 | 232 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP003357.1-201 | ENST00000604497 | 148 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC022441.3-201 | ENST00000605737 | 136 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC006441.5-201 | ENST00000612680 | 209 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC011476.5-201 | ENST00000615594 | 130 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NCRUPAR_2.1-201 | ENST00000616308 | 99 nt | BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VPS35-212 | ENST00000640313 | 141 nt | TSL 5 BASIC | -0.05 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-923P-201 | ENST00000364753 | 107 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.294-201 | ENST00000364916 | 102 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNA5SP117-201 | ENST00000365294 | 118 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.339-201 | ENST00000365325 | 102 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.450-201 | ENST00000384198 | 113 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR125B2-201 | ENST00000385128 | 89 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-510P-201 | ENST00000391239 | 108 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNORA75.4-201 | ENST00000391278 | 119 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL603910.2-201 | ENST00000407268 | 136 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR1278-201 | ENST00000408753 | 81 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-1156P-201 | ENST00000410365 | 100 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | snoU13.16-201 | ENST00000459350 | 104 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRDX4P1-201 | ENST00000507189 | 574 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU6-120P-201 | ENST00000516077 | 103 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02277-202 | ENST00000556472 | 453 nt | TSL 3 BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR5188-201 | ENST00000583467 | 113 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KIF20B-201 | ENST00000260753 | 6306 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC010332.2-201 | ENST00000613083 | 1904 nt | BASIC | -0.06 | □□□□□ -2.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Y_RNA.194-201 | ENST00000363985 | 102 nt | BASIC | -0.07 | □□□□□ -2.42 | | |