Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMPOP42166 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMPOP42166 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMPOP42166 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMPOP42166 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1497.8 ms