Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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PTPRBP23467 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRBP23467 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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