Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LRRTM2O43300 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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