Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD3Q9UJU5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD3Q9UJU5 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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