Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms