Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GDE1Q9NZC3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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