Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM53CQ9NYF3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms