Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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