Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA4CQ9C0C4 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA4CQ9C0C4 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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