Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMCN1Q96RW7 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms