Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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ZBED3Q96IU2 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED3Q96IU2 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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