Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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TOP1MTQ969P6 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TOP1MTQ969P6 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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TOP1MTQ969P6 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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