Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCBE1Q6UXH8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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