Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED9Q6R2W3 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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