Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDO1Q16878 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDO1Q16878 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms