Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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